La artemisinina y sus derivados han sido utilizados para el tratamiento de malaria y parastic helmintos (gusanos) las infecciones. Tienen la ventaja sobre otras drogas en tener una capacidad de matar más rápido y matar a todas las etapas del ciclo de vida de los parásitos.Pero baja biodisponibilidad, pobres propiedades farmacocinéticas y el alto costo de las drogas son los principales inconvenientes de su uso.El uso de la droga por sí mismo como monoterapia es explícitamente desalentados por la Organización Mundial de la salud, como ha habido indicios de que los parásitos del paludismo están desarrollando resistencia a la droga. Terapias que combinan la artemisinina o sus derivados con otros antipalúdicos son el tratamiento preferido para la malaria.